Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAP1Q03518 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms