Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
ERCC6Q03468 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
ERCC6Q03468 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms