Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDR2Q01850 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDR2Q01850 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms