Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms