Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDM2Q00987 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDM2Q00987 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDM2Q00987 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms