Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDLBPQ00341 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDLBPQ00341 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDLBPQ00341 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms