Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITPNAQ00169 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNAQ00169 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms