Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD1P98174 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD1P98174 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD1P98174 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD1P98174 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD1P98174 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FGD1P98174 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
FGD1P98174 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD1P98174 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD1P98174 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD1P98174 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD1P98174 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD1P98174 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD1P98174 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD1P98174 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD1P98174 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD1P98174 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms