Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN10P78369 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms