Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNC1P63316 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNC1P63316 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC1P63316 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms