Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTG1P63261 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTG1P63261 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms