Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSNL1P62760 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms