Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS2P61201 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS2P61201 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS2P61201 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS2P61201 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS2P61201 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS2P61201 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS2P61201 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS2P61201 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS2P61201 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS2P61201 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS2P61201 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS2P61201 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS2P61201 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS2P61201 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS2P61201 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS2P61201 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS2P61201 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS2P61201 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS2P61201 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS2P61201 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS2P61201 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS2P61201 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS2P61201 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS2P61201 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS2P61201 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS2P61201 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS2P61201 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS2P61201 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS2P61201 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS2P61201 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS2P61201 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS2P61201 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS2P61201 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS2P61201 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS2P61201 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS2P61201 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms