Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3P61158 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3P61158 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3P61158 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms