Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVFC1-1P60608 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFC1-1P60608 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms