Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVPABLB-1P60509 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVPABLB-1P60509 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms