Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC1P59894 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms