Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PROK1P58294 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PROK1P58294 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PROK1P58294 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PROK1P58294 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PROK1P58294 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PROK1P58294 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PROK1P58294 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PROK1P58294 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PROK1P58294 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PROK1P58294 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PROK1P58294 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PROK1P58294 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms