Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMDP57764 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GSDMDP57764 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSDMDP57764 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms