Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP4P57723 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP4P57723 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms