Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BACE1P56817 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BACE1P56817 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BACE1P56817 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BACE1P56817 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BACE1P56817 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BACE1P56817 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BACE1P56817 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BACE1P56817 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BACE1P56817 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BACE1P56817 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BACE1P56817 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BACE1P56817 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BACE1P56817 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BACE1P56817 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BACE1P56817 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BACE1P56817 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BACE1P56817 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BACE1P56817 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BACE1P56817 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BACE1P56817 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BACE1P56817 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BACE1P56817 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BACE1P56817 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BACE1P56817 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BACE1P56817 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BACE1P56817 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BACE1P56817 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BACE1P56817 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BACE1P56817 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BACE1P56817 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BACE1P56817 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BACE1P56817 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BACE1P56817 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BACE1P56817 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BACE1P56817 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BACE1P56817 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BACE1P56817 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BACE1P56817 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BACE1P56817 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BACE1P56817 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BACE1P56817 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BACE1P56817 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BACE1P56817 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BACE1P56817 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BACE1P56817 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BACE1P56817 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BACE1P56817 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BACE1P56817 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BACE1P56817 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BACE1P56817 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BACE1P56817 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BACE1P56817 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BACE1P56817 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BACE1P56817 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BACE1P56817 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BACE1P56817 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BACE1P56817 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BACE1P56817 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms