Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2DP55273 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2DP55273 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms