Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP9P55211 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP9P55211 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP9P55211 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP9P55211 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP9P55211 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP9P55211 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP9P55211 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP9P55211 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP9P55211 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP9P55211 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP9P55211 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP9P55211 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP9P55211 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP9P55211 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP9P55211 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP9P55211 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP9P55211 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP9P55211 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP9P55211 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP9P55211 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP9P55211 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP9P55211 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP9P55211 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms