Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP7P55210 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP7P55210 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP7P55210 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP7P55210 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP7P55210 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP7P55210 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP7P55210 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP7P55210 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP7P55210 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP7P55210 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP7P55210 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP7P55210 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP7P55210 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP7P55210 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP7P55210 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP7P55210 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP7P55210 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP7P55210 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP7P55210 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP7P55210 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP7P55210 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP7P55210 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP7P55210 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP7P55210 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP7P55210 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP7P55210 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP7P55210 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP7P55210 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP7P55210 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP7P55210 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP7P55210 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP7P55210 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP7P55210 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP7P55210 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP7P55210 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP7P55210 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP7P55210 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP7P55210 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASP7P55210 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASP7P55210 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASP7P55210 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP7P55210 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP7P55210 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP7P55210 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP7P55210 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP7P55210 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP7P55210 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP7P55210 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASP7P55210 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP7P55210 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP7P55210 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP7P55210 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP7P55210 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP7P55210 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP7P55210 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP7P55210 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP7P55210 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP7P55210 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP7P55210 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP7P55210 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP7P55210 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP7P55210 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP7P55210 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP7P55210 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms