Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A3P55017 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A3P55017 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms