Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRRX1P54821 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRX1P54821 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRX1P54821 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms