Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP12AP54707 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP12AP54707 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms