Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRISP3P54108 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CRISP3P54108 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms