Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SUCLG1P53597 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SUCLG1P53597 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms