Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2E1P51965 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E1P51965 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E1P51965 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms