Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPS6KA3P51812 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3P51812 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms