Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLCSP50747 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLCSP50747 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLCSP50747 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLCSP50747 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HLCSP50747 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLCSP50747 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLCSP50747 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLCSP50747 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLCSP50747 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLCSP50747 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLCSP50747 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLCSP50747 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLCSP50747 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLCSP50747 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLCSP50747 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLCSP50747 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLCSP50747 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms