Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSRP3P50461 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSRP3P50461 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRP3P50461 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms