Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC1P48995 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC1P48995 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC1P48995 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms