Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms