Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL1P47992 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL1P47992 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL1P47992 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL1P47992 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL1P47992 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL1P47992 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL1P47992 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL1P47992 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL1P47992 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL1P47992 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms