Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR4P46093 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR4P46093 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR4P46093 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR4P46093 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR4P46093 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR4P46093 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR4P46093 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR4P46093 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR4P46093 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR4P46093 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR4P46093 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR4P46093 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR4P46093 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR4P46093 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms