Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACAA2P42765 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACAA2P42765 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA2P42765 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms