Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3CAP42336 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3CAP42336 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CAP42336 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms