Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASIPP42127 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASIPP42127 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASIPP42127 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASIPP42127 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASIPP42127 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASIPP42127 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASIPP42127 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASIPP42127 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms