Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF9P41273 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms