Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX2P40425 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX2P40425 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX2P40425 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX2P40425 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PBX2P40425 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PBX2P40425 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PBX2P40425 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX2P40425 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX2P40425 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX2P40425 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX2P40425 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX2P40425 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX2P40425 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX2P40425 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX2P40425 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX2P40425 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX2P40425 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX2P40425 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX2P40425 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX2P40425 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX2P40425 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX2P40425 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX2P40425 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX2P40425 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX2P40425 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX2P40425 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX2P40425 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX2P40425 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX2P40425 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX2P40425 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX2P40425 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX2P40425 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX2P40425 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX2P40425 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX2P40425 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX2P40425 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX2P40425 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX2P40425 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX2P40425 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms