Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCAP37840 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCAP37840 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCAP37840 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCAP37840 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCAP37840 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNCAP37840 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNCAP37840 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCAP37840 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCAP37840 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCAP37840 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCAP37840 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms