Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX11P35716 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX11P35716 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX11P35716 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX11P35716 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX11P35716 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX11P35716 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX11P35716 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX11P35716 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX11P35716 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX11P35716 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX11P35716 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX11P35716 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX11P35716 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOX11P35716 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOX11P35716 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX11P35716 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX11P35716 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms