Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYLC1P35663 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms