Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC8A1P32418 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms