Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA13P31271 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HOXA13P31271 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA13P31271 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms