Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA11P31270 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA11P31270 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA11P31270 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms