Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRIP30626 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRIP30626 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRIP30626 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRIP30626 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRIP30626 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRIP30626 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRIP30626 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRIP30626 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRIP30626 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRIP30626 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRIP30626 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRIP30626 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRIP30626 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SRIP30626 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRIP30626 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRIP30626 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRIP30626 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRIP30626 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRIP30626 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRIP30626 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRIP30626 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms