Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCND2P30279 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCND2P30279 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND2P30279 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND2P30279 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND2P30279 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCND2P30279 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCND2P30279 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCND2P30279 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCND2P30279 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCND2P30279 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCND2P30279 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCND2P30279 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND2P30279 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND2P30279 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND2P30279 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND2P30279 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND2P30279 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND2P30279 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND2P30279 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND2P30279 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND2P30279 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND2P30279 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND2P30279 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND2P30279 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND2P30279 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND2P30279 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND2P30279 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND2P30279 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND2P30279 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND2P30279 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND2P30279 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND2P30279 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND2P30279 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND2P30279 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND2P30279 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND2P30279 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms